Nel 1949, due anni dopo gli eventi di Godzilla Minus One, la famiglia Shikishima cerca di ricostruire la propria vita in un Giappone ancora segnato dalle devastazioni della Seconda Guerra Mondiale. Mentre il Paese tenta faticosamente di rialzarsi, Godzilla riemerge, più gigantesco e distruttivo che mai, spezzando il fragile equilibrio conquistato con fatica. L’ex pilota Kōichi Shikishima (Ryûnosuke Kamiki) e Noriko Ôishi (Minami Hamabe) si ritrovano così ad affrontare una nuova, disperata lotta per la sopravvivenza, mentre il Re dei Mostri semina morte e distruzione con una violenza senza precedenti. La minaccia questa volta supera i confini del Giappone, trasformandosi in una calamità di proporzioni ancora più vaste. Di fronte a una forza apparentemente inarrestabile, la famiglia dovrà trovare ancora una volta il coraggio di reagire e opporsi alla creatura che minaccia di cancellare ogni possibilità di futuro.
